Domaines d’application

Domaines d’application

UbSeq accompagne des projets de recherche en génomique, transcriptomique, microbiologie et microbiome dans différents contextes biologiques.

Génomique constitutionnelle

Maladies rares & héréditaires

Explorer et prioriser les variants germinaux pertinents au regard du phénotype, du modèle de transmission et du contexte du projet.

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Génomique somatique

Oncologie moléculaire

Caractériser et explorer les altérations somatiques dans le cadre de projets de recherche en oncologie, en tenant compte du design et des données disponibles.

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Nutrigénétique

Nutrigénétique & réponse nutritionnelle

Explorer les associations entre variations génétiques et réponses nutritionnelles en tenant compte du contexte d’étude, de la population et du niveau de preuve.

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Transcriptomique

Expression génique & voies biologiques

Étudier les variations d’expression et les voies biologiques associées à un phénotype, une condition expérimentale ou une réponse biologique.

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Épissage, isoformes & événements transcriptomiques

Explorer les variations d’épissage, les isoformes et les événements transcriptomiques susceptibles de modifier l’interprétation fonctionnelle.

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Génomique microbienne

Maladies infectieuses & résistance aux antimicrobiens

Caractériser les organismes, lignées et déterminants de résistance à partir de données génomiques adaptées au contexte du projet.

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Surveillance génomique

Comparer des collections de souches, étudier leurs relations génomiques et caractériser la structuration des populations microbiennes.

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Microbiome & métagénomique

Microbiome

Étudier la composition, la diversité et le potentiel fonctionnel des communautés microbiennes, puis comparer leurs variations entre groupes ou conditions.

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Agents adventices

Investigation NGS d’agents adventices

Rechercher et investiguer des signaux microbiens ou viraux inattendus dans des données NGS à l’aide de contrôles et de références appropriés.

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Autre contexte

Votre domaine n’apparaît pas ?

Votre projet ne correspond pas exactement aux domaines présentés ? Présentez-nous votre question scientifique, vos données et votre objectif afin d’évaluer l’approche d’analyse la plus adaptée.