Bioinformatique & analyse de données

Analyses bioinformatiques sur mesure

UbSeq réalise des analyses bioinformatiques sur mesure en génomique, transcriptomique et analyse du microbiome, au service des chercheurs, plateformes de séquençage, laboratoires et équipes R&D.

UbSeq accompagne également la préparation des éléments bioinformatiques et documentaires attendus dans le cadre des démarches qualité et d’accréditation.

Génomique humaineTranscriptomiqueGénomique microbienneMicrobiome & métagénomiqueAudit bioinformatique
Ce qu’UbSeq apporte

Analyser, explorer et documenter

UbSeq transforme vos données en résultats structurés, exploitables et adaptés aux objectifs de chaque projet.

Analyser

Prise en charge de bout en bout, des analyses primaires aux analyses secondaires et tertiaires, avec des méthodes statistiques adaptées aux données et à la question biologique.

Explorer

Figures, tableaux et interfaces interactives pour filtrer, comparer et approfondir les résultats. Des visualisations prêtes pour publication peuvent également être fournies.

Documenter

Documentation bioinformatique, traçabilité et qualification de pipelines pour les besoins du projet et les démarches qualité.

Exemples de résultats

Découvrez quelques exemples de résultats UbSeq

Ces démonstrations montrent quelques exemples de figures, tableaux et analyses interactives développés par UbSeq. Les résultats fournis sont adaptés aux données, à la question scientifique et au niveau d’analyse de chaque projet.

Aperçu du rapport de variants constitutionnels
Génomique humaine

Variant Explorer constitutionnel

Filtres, priorisation, QC technique, hérédité et détail de chaque variant.

Explorer l’exemple →
Aperçu du rapport de variants somatiques
Génomique humaine

Variant Explorer somatique

VAF tumorale, normal apparié, support de lecture, contexte copy-number et confiance somatique.

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Aperçu du rapport de métagénomique shotgun
Microbiome & métagénomique

Profilage métagénomique · Shotgun

Composition au niveau espèce, diversité, raréfaction et structure des communautés microbiennes.

Explorer l’exemple →
Du projet aux résultats

Une prise en charge claire à chaque étape

01

Définir

Question scientifique, design expérimental, données, métadonnées, contraintes et résultats attendus.

02

Analyser

Contrôles qualité, traitements bioinformatiques et méthodes statistiques adaptés au projet.

03

Restituer

Figures, tableaux et rapports organisés autour des questions scientifiques.

04

Accompagner

Interprétation bioinformatique, revue, documentation ou transfert de compétences selon le besoin.

Domaines d’application

Des questions scientifiques clairement identifiées

Maladies rares, oncologie, nutrigénétique, expression génique, microbiologie, microbiome et investigation NGS d’agents adventices.

Votre projet

Une question, des données ou un besoin d’analyse ?

Présentez votre contexte à UbSeq pour définir l’analyse, le niveau d’accompagnement et les résultats attendus.