Expertise bioinformatique et analyses omiques sur mesure
UbSeq accompagne laboratoires, équipes de recherche, entreprises, chercheurs et porteurs de projets scientifiques dans leurs besoins en bioinformatique.
De la définition de la stratégie d’analyse au traitement des données, à leur interprétation et à la restitution des résultats, UbSeq propose des prestations bioinformatiques sur mesure, claires et adaptées à chaque projet.
Une expertise mobilisable à chaque étape du projet
Cadrage analytique, traitement des données, modélisation, automatisation et restitution sont articulés selon les exigences scientifiques du projet.
Analyse bioinformatique & données omiques
Qualification des données, workflows adaptés, analyses statistiques et interprétation dans le cadre du design de l’étude.
Voir le service →Conseil & stratégie d’analyse
Conception du plan d’analyse, choix des contrôles et covariables, revue méthodologique et stratégie d’interprétation.
Voir le service →Pipelines & automatisation
Workflows versionnés et reproductibles, avec gestion explicite des paramètres, dépendances et environnements d’exécution.
Voir le service →Reporting & outils scientifiques
Résultats structurés, figures, rapports et documentation de la provenance analytique pour faciliter revue, partage et réutilisation.
Voir le service →Formation & transfert de compétences
Formations pratiques adaptées au niveau, aux données et aux objectifs, en individuel ou en groupe.
Voir le service →Expertise scientifique & analytique
Génomique humaine
Variation germinale et somatique, CNV/SV, annotation, priorisation et analyses de cohortes orientées recherche.
Génomique microbienne & pathogènes
Caractérisation génomique, typage, génomique comparative, phylogénomique et déterminants de résistance ou de virulence.
Transcriptomique
Quantification, modélisation de l’expression, analyses différentielles, épissage et interprétation fonctionnelle.
Microbiome & métagénomique
Profilage taxonomique et fonctionnel, structure des communautés, analyses compositionnelles et intégration des métadonnées.
Biostatistiques & intégration de données
Design d’étude, modélisation statistique, contrôle des covariables, validation, intégration de données et visualisation.
Rigueur analytique, traçabilité & reproductibilité
Une analyse robuste repose sur un design cohérent, des données qualifiées et une provenance analytique explicite. Les méthodes, références, versions, paramètres et décisions critiques sont documentés au niveau requis par le projet.
Découvrir l’approche UbSeq →Des méthodes guidées par le design et l’hypothèse scientifique
Le choix des méthodes découle du design de l’étude, de la structure des données, des contrôles disponibles et du niveau d’inférence attendu.
Un cadre conçu pour produire des résultats interprétables et reproductibles
Chaque mission est structurée autour des éléments qui conditionnent la validité, la traçabilité et l’interprétation des résultats. Voir les modes de collaboration →
Design de l’étude
Hypothèses, cohortes, contrastes, contrôles, covariables et critères d’interprétation sont explicités en amont.
Qualification des données
Qualité, provenance, métadonnées, références et facteurs techniques sont évalués avant les analyses en aval.
Analyse & inférence
Les traitements et modèles statistiques sont appliqués avec des contrôles adaptés et une provenance analytique explicite.
Restitution reproductible
Résultats, méthodes, paramètres et limites sont structurés pour faciliter lecture, revue et réutilisation.
Vous avez des données à analyser ou une stratégie à définir ?
Décrivez brièvement votre besoin. Aucun fichier ni donnée sensible n’est demandé dans le formulaire public.