De la préparation de l’analyse à l’interprétation des résultats, UbSeq accompagne les projets de génomique, transcriptomique et microbiologie avec une stratégie adaptée aux données, au contexte scientifique et au niveau de restitution attendu.
Identifier, prioriser et interpréter les variants germinaux pertinents au regard du phénotype et du contexte du projet.
Caractériser les altérations génomiques acquises dans des projets de recherche en oncologie et autres contextes somatiques.
Explorer les associations entre variants génétiques, phénotypes nutritionnels et contexte biologique en tenant compte du niveau de preuve disponible.
Analyser les changements d’expression et les événements transcriptomiques afin de relier les données RNA-seq au contexte biologique.
Caractériser et comparer des génomes microbiens pour des projets de recherche, de caractérisation ou de surveillance.
Caractériser la composition, la diversité et le potentiel fonctionnel de communautés microbiennes à partir de données de séquençage.
Rechercher et investiguer des signaux microbiens ou viraux inattendus en combinant spécificité taxonomique, couverture, assemblage et contrôles.
Revue indépendante, qualification du pipeline, tests de non-régression, traçabilité des changements et préparation des éléments bioinformatiques utiles à une démarche qualité ou d’accréditation.
UbSeq peut confirmer la faisabilité et proposer un périmètre adapté aux données et aux résultats attendus.
