Audit d’un pipeline existant
Revue structurée des étapes, paramètres, dépendances logicielles, versions, contrôles, résultats et éléments de traçabilité disponibles.
Revue d’un pipeline existant, qualification d’une nouvelle version, stratégie de tests de non-régression, traçabilité et documentation bioinformatique pour les démarches qualité ou d’accréditation.
Revue structurée des étapes, paramètres, dépendances logicielles, versions, contrôles, résultats et éléments de traçabilité disponibles.
Définition du périmètre, jeux de tests de référence, cas limites, critères d’acceptation, métriques à suivre et preuves de fonctionnement attendues.
Analyse d’impact, comparaison des versions, jeux de tests de non-régression et documentation des changements.
Structuration des éléments bioinformatiques : description du pipeline, versions, jeux de tests, critères d’acceptation, résultats de qualification et traçabilité.
Dans une méthode NGS, la chaîne bioinformatique fait partie des éléments à qualifier et à documenter dans la stratégie globale de vérification ou de validation. Le périmètre dépend de l’usage prévu, des performances attendues et des changements de version.
Référence utile : Cofrac SH GTA 16.
Préparer une qualification initiale, évaluer une mise à jour, définir une stratégie de non-régression, revoir la traçabilité ou consolider un dossier bioinformatique.
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