Expression différentielle
Volcano, heatmap et MA plot comme vues complémentaires.
Explorer l’exemple →Transcriptomique
Transcriptomique · RNA-seq & événements aberrants
De la structure de cohorte à l’expression différentielle, l’épissage et l’interprétation fonctionnelle, avec des vues complémentaires plutôt qu’un graphique isolé.
Bulk RNA-seq
Contrôle qualité, quantification, normalisation, exploration des échantillons, analyse des covariables, expression différentielle et correction des tests multiples.
- PCA et structure de cohorte
- Heatmap, volcano et MA plot
- Tableaux différentiels complets
- Enrichissement fonctionnel et GSEA
Expression outlier & épissage aberrant
Analyse au niveau individuel pour repérer des signaux d’expression atypiques ou des événements d’épissage candidats par comparaison à une cohorte ou à un ensemble de référence approprié.
Interprétation fonctionnelle
Pathway enrichment et GSEA permettent de replacer les signaux transcriptomiques dans des processus biologiques tout en conservant les effets, FDR, direction et éléments de leading edge utiles à la revue.
Résultats fournis
Matrices d’expression, tableaux de résultats, figures de contrôle et comparaison, analyses fonctionnelles, méthodes, synthèse scientifique et rapport interactif selon le projet.
Exemples de restitution
Épissage aberrant
Événement sélectionné, métrique observée/attendue, FDR, support de reads et schéma exon–intron.
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Pathway Enrichment + GSEA
Interprétation fonctionnelle du signal transcriptomique.
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