Somatic Variant Explorer
Revue tumor–normal centrée sur VAF, profondeur et support technique.
Explorer l’exemple →Génomique somatique
Variants somatiques
Analyse d’altérations somatiques dans des projets de recherche, avec une stratégie adaptée au design tumor–normal ou tumor-only, aux données disponibles et au niveau de restitution attendu.
Données & design
L’analyse est définie à partir du type de séquençage, de la présence ou non d’un normal apparié, de la profondeur et du contexte expérimental.
Analyse bioinformatique
- Revue des SNV et indels somatiques
- VAF, profondeur et support alternatif
- Comparaison au normal apparié lorsqu’il est disponible
- CNV, LOH ou altérations structurales selon les données
- Annotation et priorisation des candidats
Résultats fournis
Tableaux de variants annotés, métriques de support, éléments de contrôle qualité, figures de synthèse, méthodes et rapport interactif selon le projet.
Exemple interactif